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_covdock-薛定谔 共价对接 CovDock | TMPRSS2 抑制剂Antipain结合模式预测 | 自定义反应类型 | 抗新冠
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April-Alex:COVPDB: https: //doi.org/10.1093/nar/gkab868 http://www.pharmbioinf.uni-freiburg.de/covpdb/
钰沐菡:修改cdock文件不是必须的,如果对接少量化合物,可以直接对接,结果出来后挑选想要的那个就行。但是如果批量对接很多的话,分析结果的时候一个一个挑选很费事,就可以尝试修改cdock文件,这样结果文件包含的就都是受体和选择出来的那个reaction site的共价结合结果了。
高学博士后:我是做药物化学的,也加在了姐姐的微信群里,不过这次这个共价对接,想模仿这个先导共价化合物Nafamostat,应该也用活性酯(e.g. 羧酸苯酚酯),肽键还是比较稳定的理论上不能跟丝氨酸这样的弱亲核性氨基酸进行共价反应。这次又又又学到了很多,包括那个 COVPDB, 惊喜。
冬天到了快醒醒:看了动态,特意过来点赞的(快夸我[吃瓜])
榆木麻友:UP主不要伤心,因为视频上线的时候是在晚上。我们都没来得及看。这不,早上就一键[热词系列_三连]了。[支持][支持]
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